Tutoriels: ZOTERO

Un article de Wiki URFIST.

Sommaire

[modifier] TUTORIEL N°1 : INTRODUCTION et INSTALLATION DE ZOTERO

[modifier] Introduction

ZOTERO est un logiciel (libre et gratuit) de gestion de références bibliographiques qui vous permet:

  • de collecter des références automatiquement ou manuellement
  • d’organiser vos références dans une bibliothèque classée en collections et sous-collections
  • d'importer vos références dans un traitement de texte pour un travail de recherche
  • de synchroniser votre bibliothèque de références avec le serveur Zotero vous permettant de sauvegarder et utiliser votre bibliothèque sur plusieurs ordinateurs
  • d’élaborer des bibliographies en collaboration avec d’autres utilisateurs et de partager des sources

[modifier] Installer Zotero

Pour installer Zotero :

  • lancez votre navigateur
  • et connectez-vous au site de Zotero, http://www.zotero.org/
  • cliquez sur « Download".

Zotero est à l’origine un plug-in, une extension pour le navigateur Firefox mais il est désormais possible de l'utiliser Zotero d’autres navigateurs (version logiciel = "standalone"), choisissez l'option qui vous convient. Pour une installation facile,nous choisissons Firefox, cliquez donc ici.

Une fenêtre d'installation apparaît alors, suivez les instructions puis redémarrez votre navigateur pour finaliser l’installation de Zotero sur votre navigateur. Ca y est, Zotero est installé comme l’indique l'icône ZOTERO qui se trouve en bas à droite de la fenêtre de votre navigateur. Un simple clic sur l’icône permet de déployer l’interface du logiciel Zotero. Recliquer sur l’icône pour la fermer. Vous pouvez agrandir la fenêtre Ou revenir à l’affichage normal.

L’interface Zotero se compose de 3 colonnes :

  • La colonne de gauche affiche les collections et les sous-collections et constituent votre bibliothèque.
  • Dans la colonne du milieu, vous pouvez voir la liste des références qui composent chacune de vos collections et sous-collections. Vous pouvez trier ces références par critères.
  • Dans la colonne de droite, vous pouvez voir en détail chacune vos références et directement modifier le contenu des champs à la main.

Ainsi, nous allons voir dans un 2ème tutoriel comment collecter des références au gré de votre navigation sur le net.

[modifier] TUTORIEL N°2 : COLLECTER DES INFORMATIONS BIBLIOGRAPHIQUES

Une fois Zotero installé sur votre navigateur, chaque fois que vous trouverez sur le web des références intéressantes lors de la consultation de ressources : base de données, catalogues, revues, outils de recherche, etc, vous pourrez les sauvegarder dans votre bibliothèque Zotero. Zotero extrait des références bibliographiques depuis de nombreuses ressources. Lorsque vous visitez une ressource compatible, une icône dans la barre de navigation (OU URL ?? cf juste en dessous) vous indique qu’il est possible d’importer des références dans votre bibliothèque.

[modifier] Importation automatique des références bibliographiques

En effet, effectuons par exemple une recherche dans le moteur de recherche Google Scholar : tapez vos mots-clés, Zotero affiche alors dans la barre d'URL une icône en fonction du type de document. Un simple clic vous permet alors d’importer les références bibliographiques :

  • cliquez sur l’icône représentant un répertoire jaune vous affiche une liste de références, vous n’avez qu’à cocher le ou les éléments que vous souhaitez ajouter à votre bibliothèque, ce qui vous permet donc d’importer plusieurs références à la fois.

impossible dans Scholar montrer d'autres ressources par exemple : revues.org, HAL pour la feuille, le SUDOC, Gallica pour le livre, et ScienceDirect pour l'export en RIS ou BibTeX (cela permet d'éviter de citer "endnote", et de renvoyer sur standard, à un autre tuto ou sur la doc de Zotero. * l’icône ‘feuille’ vous permet d’ajouter un article à votre bibliothèque

  • l’icône ‘livre’ vous permet d’ajouter un livre à votre bibliothèque
  • vous pouvez également cliquer sur « Importer dans EndNote »

Comme vous pouvez le remarquer dans la colonne du milieu, les références ont été automatiquement importées dans votre bibliothèque (ou sur la collection préalablement sélectionnée). Ce que vous venez de faire sur Google Scholar marche également avec le SUDOC par exemple (démo) mais également avec une base de données classique telle que Science Direct (démo). => cf remarque ci-dessus

[modifier] Associer un document à une référence

Vous pouvez également associer des fichiers à une référence (démo)comme par exemple un fichier PDF, des notes, des captures d’écran, etc…

Dire ici ou lors de la demo sous ScienceDirect que le Pdf peut (si compatible) être intégré/enregistrer/récupérer avec (en même temsp) que la ref

===Document seul=== Mais vous pouvez très bien ajouter un document seul sans nécessairement l’associer à une référence (démo) => à mon avis ça n'a pas d'intérêt si on ne montre pas la "génération" de la ref à partir du PDF (cf partie ci-dessous)


Tout cela vous permet ainsi de constituer votre bibliothèque de références de manière automatique. Il y a cependant d’autres façons d’ajouter des références à votre bibliothèque :


[modifier] Ajout manuel d’une entrée dans la bibliothèque

  • cliquez sur l’icône « Nouveau document »
  • sélectionnez le type de document à ajouter (vous pouvez cliquer sur « Plus » pour afficher des possibilités supplémentaires. Une entrée vierge est alors ajoutée à votre bibliothèque. Vous pouvez alors manuellement saisir les informations sur votre référence.

[modifier] Générer la référence à partir du PDF - Récupération des métadonnées d’un PDF(valable pour certains PDF)

Glissez-déposez dans votre bibliothèque le fichier dont vous souhaitez récupérer les métadonnées. Le document est alors intégré à la bibliothèque en tant que pièce autonome non associée à une référence existante. Faites un clic droit sur le fichier PDF et sélectionnez « Récupérer les métadonnées du PDF » (la première fois il y a l'installation de 2 outils supplémentaires PDFInfo, PDFtoText => comment intégrer ça dans le tuto ? ) . Une fenêtre vous indique la progression de la récupération des données du fichier PDF.

[modifier] Récupération des références par ISBN, DOI, PMID

Repérez l’identifiant du document à ajouter (n° ISBN, DOI, PMID) et cliquez sur le bouton « Ajouter un élément par son identifiant ». La référence est alors ajoutée à la bibliothèque.


Si le document est indexé dans la source ou la base de données où vous avez effectué votre recherche, les informations concernant la référence sont ajoutées automatiquement. => pas clair à préciser ensemble ou à supprimer Si les informations sont incomplètes, vous pouvez saisir les informations manquantes à la main (démo).


Nous verrons dans un 3ème tutoriel comment gérer et organiser vos références.


[modifier] TUTORIEL N°3 : Gestion des références bibliographiques

Dans le tutoriel précédent, nous avons vu comment importer des références dans votre bibliothèque Zotero.Une fois que les références ont été importées, Zotero vous permet des les gérer et de les organiser.

[modifier] 1) Collections, annotations, fichiers

[modifier] a) Collections et sous-collections

Pour créer des collections et des sous collections, cliquez sur « Nouvelle collection » et donner un nom à votre nouvelle collection. Vos nouvelles collections apparaitront sous forme de dossier dans votre bibliothèque (cliquer sur la flèche pour les faire apparaître) Des sous-collections peuvent être crées, pour cela sélectionnez et déplacez une collection dans une autre collection ou cliquez droit sur une collection puis sélectionnez « Nouvelle sous-collection » Ajouter des références à des collections Sélectionnez un élément dans la colonne du milieu et faites la glisser dans une collection.Il faut noter qu’une référence peut être assignée à plusieurs collections sans pour autant être dupliquée dans la colonne du milieu. Renommer une collection Faites un clic droit sur la collection et choisissez « Renommer la collection » et entrez un nouveau nom. Supprimer une collection Faites un clic droit sur la collection et choisissez « Supprimer la collection » Supprimer une référence d’une collection Sélectionnez la collection dans laquelle se trouve la référence que vous souhaitez supprimer, sélectionnez la référence, et cliquez droit puis sélectionnez « Supprimer la référence ». Cela supprime seulement la référence de la collection sélectionnée pas de « Ma bibliothèque » ou des autres colelctions dans lesquelles cette référence se trouverait. Si vous voulez supprimer une référence de « Ma bibliothèque » et donc de toutes les collections et sous-collection dans lesquelles elle se trouve, cliquez sur « Ma bibliothèque », sélectionnez la référence en question dans la colonne du milieu, clic droit, « Supprimer la référence de la bibliothèque ».


[modifier] 2) Annotations d’une référence

[modifier] a) Créer une note

Le bouton Nouvelle note indépendante ( ) permet de créer une note qui sera stockée dans une collection. Pour rattacher une note à un élément, faites la glisser sur cet élément.

[modifier] b) Associer une note à une référence

Vous pouvez directement associer une note à une référence en utilisant l’onglet « Notes » dans la colonne de droite ou le menu contextuel (en effectuant un clic-droit sur la référence). c) Créer une note à partir d’un texte sélectionné Vous pouvez également créer une note à partir d’un texte sélectionné sur une page web : pour cela sélectionnez le texte, clic droit, « Zotero », « Créer une note à partir de la sélection ».

[modifier] 3) Marqueurs / tags

[modifier] a) Ajouter un marqueur à une référence

Ajouter des marqueurs (tags), permet de classer les éléments grâce aux mots-clés Pour ajouter un marqueur à une référence : dans la colonne du milieu, sélectionnez la référence, cliquez sur le bouton « Marqueurs » dans la colonne de droite

[modifier] b) Afficher les marqueurs

Le bouton Montrer/Cacher le sélecteur de marqueurs (palette couleurs) permet d’afficher tous les marqueurs attachés aux références. Cliquez sur cet icône et sélectionnez « Affichez tous les marqueurs de cette bibliothèque ». Sélectionnez un ou plusieurs marqueurs parmi ceux affichés, les références portant ces marqueurs seront alors affichées dans la colonne du milieu. Pour désélectionnez tous les marqueurs en même temps, cliquez sur la palette couleur et choisissez « Tout désélectionner »

[modifier] c) Filtrer les marqueurs

Le champ Filtre permet de filtrer vos marqueurs. Cliquer sur la palette couleurs puis « Afficher tous les marqueurs de cette bibliothèque ». Cliquez sur un marqueur => dans la colonne du milieu, toutes le références portant ce marqueur s’affichent.

[modifier] d) Supprimer un marqueur

Pur supprimer entièrement un marqueur, clic droit sur le marqueur (« Effacer le marqueur »). Pour supprimer un marqueur associé à une référence, sélectionnez la références, bouton « Marqueur », clic sur le « moins ».

[modifier] 4) Options de recherche

Zotero propose de nombreuses fonctionnalités vous permettant de retrouver rapidement les références dont vous avez besoin.

[modifier] a) Le tri

Pour trier les éléments d'une collection, cliquez sur le libellé de la catégorie d'information, en haut de la colonne du milieu. Par exemple, si vous cliquez sur “Titre”, les éléments seront triés alphabétiquement en fonction de la première lettre du titre. Cliquer une seconde fois sur le même libellé inverse l'ordre de tri. De la même manière, vous pouvez cliquer sur le libellé “Auteur” pour trier vos éléments par nom d'auteur… et ainsi de suite. Pour ajouter d'autres libellés, et donc afficher d’autres catégories d'information dans la colonne du milieu, utilisez le bouton en haut à droite de la colonne du milieu. L'activation du bouton ouvre un menu supplémentaire proposant une liste de critères. Cocher un critère, ajoute une catégorie d'information utilisable pour le tri.

[modifier] b) Recherche simple

Elle est accessible directement depuis la barre d’outils (« Recherche »). Le moteur effectue alors une recherche dans toutes les zones de la notice, les marqueurs associés ainsi que les PDF si ceux-ci sont indexés. Les résultats sont présentés dans la colonne du milieu.

[modifier] c) Recherche avancée

Le bouton recherche avancée (loupe) ouvre la fenêtre de recherche. Les critères de recherche sont nombreux, vous pouvez ajouter ou supprimer des champs.

[modifier] 5) Détection des doublons

En ajoutant des références à votre bibliothèque Zotero, il se peut que vous introduisiez des références déjà présentes dans votre bibliothèque. Zotero vous permet d’identifier ces doublons.

[modifier] a) Identifier les doublons

Les doublons détectés par Zotero s’affichent dans une collection spéciale de votre bibliothèque « Doublons ». Pour rendre cette collection de doublons visible, cliquez sur la petite flèche à côté de « Ma bibliothèque » et cliquer sur « Doublons ». La collection « Doublons » apparaît dans la colonne de gauche et son contenu dans la colonne centrale : ce sont les références que Zotero a identifié comme des potentiels doublons.

[modifier] b) Fusionner les doublons

Après avoir sélectionné la collection « Doublons » (« Duplicate Items ») dans la colonne de gauche, choisissez une référence dans la colonne centrale, Zotero va automatiquement sélectionner le ou les références qu’il identifie comme des doublons. Cliquez sur le bouton « Fusionner les x documents » (« Merge x items ») dans la colonne de droite pour les fusionner. Dans un 4ème tutoriel, nous verrons comment créer une liste bibliographique depuis les collections de votre bibliothèque Zotero et comment les intégrer dans un logiciel de traitement de texte.